摘要:
目的 采用計(jì)算機(jī)輔助模擬設(shè)計(jì)對(duì)環(huán)糊精的包合作用進(jìn)行理論研究,從分子水平對(duì)β-環(huán)糊精(β-CD)包合阿德福韋(PMEA)的可行性進(jìn)行研究和探討。方法 受體β-CD結(jié)構(gòu)取自劍橋晶體結(jié)構(gòu)庫(kù)中“HEGXUM”的晶體復(fù)合物,不同價(jià)態(tài)的配體PMEA在OPLAS2005分子力場(chǎng)下經(jīng)過(guò)優(yōu)化后,以對(duì)接方法研究包合作用。結(jié)果 在包合過(guò)程中,PMEA容易被β-CD包合,包合后容易形成PMEA-β-CD包合物;包合過(guò)程中以β-CD∶PMEA=2∶1包合較β-CD∶PMEA=1∶1包合更容易形成包合物;分子間的范德華作用能起主要作用,而靜電作用能起次要作用;配體 PMEA 所帶的價(jià)電荷數(shù)也會(huì)對(duì)包合作用產(chǎn)生影響,PMEA在中性或帶正電時(shí)可能有利于β-CD單分子包合,帶負(fù)電荷有利于雙分子β-CD包合。結(jié)論 β-CD與PMEA容易形成PMEA-β-CD包合物,包合的模式受β-CD摩爾比例和PMEA的帶電狀態(tài)的影響。