摘要:
目的 運用網(wǎng)絡藥理學及分子對接技術研究蜈蚣抗膠質母細胞瘤的多成分、多靶點、多通路作用機制。方法 通過BATMAN-TCM、HERB數(shù)據(jù)庫以及文獻查找獲得蜈蚣的相關成分,并通過SwissTargetPrediction預測靶點;在GeneCards、OMIM、TTD數(shù)據(jù)庫查找獲得膠質母細胞瘤的相關靶點;將二者匯總去重后取交集得到蜈蚣抗膠質母細胞瘤的潛在靶點。將交集基因導入STRING進行蛋白相互作用(PPI)分析后生成PPI網(wǎng)絡圖,用Cytoscape進行網(wǎng)絡拓撲分析,并利用CytoNCA插件確定核心靶點和核心藥物成分,并做“藥物–成分–靶點”圖。在DAVID數(shù)據(jù)庫開展基因本體(GO)生物功能及京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路富集分析,用Cytoscape繪制“藥物成分–疾病靶點–通路”圖。通過AutoDock Vina進行分子對接驗證。結果 篩選出蜈蚣有效成分46個,靶點708個。膠質母細胞瘤靶點2 151個,得到180個交集基因。GO富集分析得到997個條目,153個KEGG富集分析通路,主要涉及癌癥途徑、細胞凋亡、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B1(Akt)信號通路、腫瘤壞死因子信號通路和ErbB信號通路等。通過CytoNCA分析篩選出Akt1、致癌轉錄因子信號轉導和轉錄激活因子3(STAT3)、表皮生長因子受體(EGFR)、轉錄因子(JUN)、原癌基因酪氨酸蛋白激酶(Src)等可能為核心靶點,環(huán)(L-苯丙-L-酪)二肽、環(huán)(L-苯丙-L-脯)二肽、環(huán)(L-纈-L-脯)二肽、N-乙酰基-2-苯基乙胺、環(huán)(L-亮-L-脯)二肽等可能為蜈蚣抗膠質母細胞瘤的核心成分。分子對接驗證得出,核心成分與核心靶點均能較好結合。結論 蜈蚣抗膠質母細胞瘤涉及環(huán)(L-苯丙-L-酪)二肽、環(huán)(L-苯丙-L-脯)二肽、環(huán)(L-纈-L-脯)二肽、N-乙?;?2-苯基乙胺、環(huán)(L-亮-L-脯)二肽,Akt1、STAT3、EGFR、JUN、Src和PI3K/Akt信號通路、腫瘤壞死因子信號通路和ErbB信號通路等多成分、多靶點、多通路途徑。