摘要:
目的 運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)及分子對(duì)接技術(shù)研究蜈蚣抗膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的多成分、多靶點(diǎn)、多通路作用機(jī)制。方法 通過(guò)BATMAN-TCM、HERB數(shù)據(jù)庫(kù)以及文獻(xiàn)查找獲得蜈蚣的相關(guān)成分,并通過(guò)SwissTargetPrediction預(yù)測(cè)靶點(diǎn);在GeneCards、OMIM、TTD數(shù)據(jù)庫(kù)查找獲得膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的相關(guān)靶點(diǎn);將二者匯總?cè)ブ睾笕〗患玫津隍伎鼓z質(zhì)母細(xì)胞瘤的潛在靶點(diǎn)。將交集基因?qū)隨TRING進(jìn)行蛋白相互作用(PPI)分析后生成PPI網(wǎng)絡(luò)圖,用Cytoscape進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浞治?,并利用CytoNCA插件確定核心靶點(diǎn)和核心藥物成分,并做“藥物–成分–靶點(diǎn)”圖。在DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)開展基因本體(GO)生物功能及京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路富集分析,用Cytoscape繪制“藥物成分–疾病靶點(diǎn)–通路”圖。通過(guò)AutoDock Vina進(jìn)行分子對(duì)接驗(yàn)證。結(jié)果 篩選出蜈蚣有效成分46個(gè),靶點(diǎn)708個(gè)。膠質(zhì)母細(xì)胞瘤靶點(diǎn)2 151個(gè),得到180個(gè)交集基因。GO富集分析得到997個(gè)條目,153個(gè)KEGG富集分析通路,主要涉及癌癥途徑、細(xì)胞凋亡、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B1(Akt)信號(hào)通路、腫瘤壞死因子信號(hào)通路和ErbB信號(hào)通路等。通過(guò)CytoNCA分析篩選出Akt1、致癌轉(zhuǎn)錄因子信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和轉(zhuǎn)錄激活因子3(STAT3)、表皮生長(zhǎng)因子受體(EGFR)、轉(zhuǎn)錄因子(JUN)、原癌基因酪氨酸蛋白激酶(Src)等可能為核心靶點(diǎn),環(huán)(L-苯丙-L-酪)二肽、環(huán)(L-苯丙-L-脯)二肽、環(huán)(L-纈-L-脯)二肽、N-乙?;?2-苯基乙胺、環(huán)(L-亮-L-脯)二肽等可能為蜈蚣抗膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的核心成分。分子對(duì)接驗(yàn)證得出,核心成分與核心靶點(diǎn)均能較好結(jié)合。結(jié)論 蜈蚣抗膠質(zhì)母細(xì)胞瘤涉及環(huán)(L-苯丙-L-酪)二肽、環(huán)(L-苯丙-L-脯)二肽、環(huán)(L-纈-L-脯)二肽、N-乙?;?2-苯基乙胺、環(huán)(L-亮-L-脯)二肽,Akt1、STAT3、EGFR、JUN、Src和PI3K/Akt信號(hào)通路、腫瘤壞死因子信號(hào)通路和ErbB信號(hào)通路等多成分、多靶點(diǎn)、多通路途徑。